Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms