Protein–RNA interactions for Protein: Q6IN84

MRM1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRM1Q6IN84 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MRM1Q6IN84 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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