Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP170Q5SW79 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms