Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYTL3Q4VX76 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms