Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBPF8Q3BBV2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms