Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TWISTNBQ3B726 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TWISTNBQ3B726 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms