Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC96Q2M329 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms