Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KNOP1Q1ED39 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms