Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CDO1Q16878 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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CDO1Q16878 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms