Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFA9Q16795 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms