Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
E2F4Q16254 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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E2F4Q16254 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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E2F4Q16254 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2F4Q16254 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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