Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ZNF56Q15929 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms