Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SIX1Q15475 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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SIX1Q15475 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SIX1Q15475 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SIX1Q15475 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SIX1Q15475 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SIX1Q15475 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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