Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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SEC23BQ15437 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SEC23BQ15437 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SEC23BQ15437 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SEC23BQ15437 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SEC23BQ15437 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SEC23BQ15437 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SEC23BQ15437 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SEC23BQ15437 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SEC23BQ15437 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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SEC23BQ15437 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
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SEC23BQ15437 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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SEC23BQ15437 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
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SEC23BQ15437 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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SEC23BQ15437 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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