Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BRD3Q15059 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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