Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TRAM2Q15035 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms