Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms