Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMC1AQ14683 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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