Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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GTF2H2Q13888 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GTF2H2Q13888 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GTF2H2Q13888 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GTF2H2Q13888 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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GTF2H2Q13888 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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GTF2H2Q13888 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF2H2Q13888 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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