Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTAN1Q13813 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms