Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM28Q13263 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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