Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CALCOCO2Q13137 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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