Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GPS1Q13098 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPS1Q13098 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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