Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STRN3Q13033 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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