Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTDSPL2Q05D32 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms