Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHRNEQ04844 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms