Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IRF8Q02556 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms