Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDR2Q01850 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDR2Q01850 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms