Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OTUD4Q01804 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms