Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN7AQ01118 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms