Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLTCQ00610 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms