Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IRX1P78414 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IRX1P78414 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IRX1P78414 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IRX1P78414 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms