Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB4BP68371 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms