Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UFM1P61960 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UFM1P61960 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UFM1P61960 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UFM1P61960 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms