Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERFP50548 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERFP50548 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERFP50548 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERFP50548 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERFP50548 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms