Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ME1P48163 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ME1P48163 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ME1P48163 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ME1P48163 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ME1P48163 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms