Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GNPDA1P46926 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GNPDA1P46926 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms