Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ETV4P43268 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms