Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC26A3P40879 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms