Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBX2P40425 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBX2P40425 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBX2P40425 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBX2P40425 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBX2P40425 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBX2P40425 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBX2P40425 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBX2P40425 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBX2P40425 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBX2P40425 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms