Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KDRP35968 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KDRP35968 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KDRP35968 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms