Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PTGS2P35354 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms