Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GJA4P35212 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GJA4P35212 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms