Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms