Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC13P31276 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms