Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM4SF1P30408 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF1P30408 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms