Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLD1P28340 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POLD1P28340 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POLD1P28340 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms