Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms