Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRGP23470 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
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