Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CXCL2P19875 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms